Die AGoFF-Forschungsstellen haben sich als zweckmäßig erwiesen, weil das Material für die einzelnen Forschungsgebiete dort gezielt gesammelt und spezielle Fragen regionaler Art von dort beantwortet werden können. Es gibt derzeit folgende Forschungsstellen:
| Baltikum | Donauschwaben und Ungarn | Galizien und Bukowina |
| Mittelpolen | Neumark (Ostbrandenburg) | Ost- und Westpreußen |
| Pommern | Posen | Rußlanddeutsche |
| Schlesien | Sudetenland | Südosteuropa |
| Wolhynien |